A diferencia de los juegos anteriores que presentaban una escena cinematográfica como final, Call of Pripyat presenta un final de varias partes, que cubre el destino de las diferentes áreas y personajes principales que se encuentran en el juego. Los finales toman la forma de una presentación de diapositivas narrada que detalla el destino de cada personaje después del escape final de Pripyat y la evacuación de los sobrevivientes de la Operación Puente.
El final cuenta con un total de hasta 20 segmentos diferentes. Algunos segmentos tienen múltiples resultados posibles dependiendo de las acciones del jugador a lo largo del juego, mientras que otros segmentos solo ocurren si el jugador ha completado una misión secundaria relevante.
Como recompensa por completar con éxito su investigación, Degtyarev es premiado con un ascenso anticipado al cargo de coronel. Pero éste rechazó ocupar un cómodo puesto de oficina y en su lugar solicita ser enviado a La Zona como observador permanente del servicio de seguridad.
Final por defecto
Laboratorios X[]
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Narración
Condición
1
La información de Degtyarev sobre los dispositivos psíquicos puso en alerta a los comandantes de la USS. Toda la información de los laboratorios X se elimino de los archivos militares y se clasifico como confidencial. Todo el personal de la Zona recibió ordenes de no revelar dichos datos bajo ningún concepto
Final por defecto
Proyecto 62[]
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Narración
Condición
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Se realizaron varios experimentos tomando como base diversos documentos técnicos sobre el objeto 62. Tras una serie de pruebas, se decidió no seguir adelante con el despliegue a gran escala del arma dado el alto coste de munición que supondría. De todas formas, existen pruebas de que todavía se sigue trabajando en el desarrollo del Fusil Gauss.
Tras fracasar su intento de capturar la nave Sultán y su grupo abandonaron Skadovsk para seguir con sus oscuros negocios en otra parte. Esto creo un ambiente de relativa seguridad entre los stalkers pero también un aumento desmesurado del numero de Artefactos vendidos a Barbas. Su hasta entonces tranquilo bar de Skadovsk se hizo tan famoso como Los 100 Rads y todo esto estando casi en el centro de la Zona.
Completar las misiones Decide que hacer y Transacción a favor de los Solitarios y obtén el logro Uno de los nuestros
2
Skadovsk se convirtió en tierra de bandidos, todos los stalkers tenían que pagar un impuesto, pero las disputas en la nave se redujeron dramáticamente tras echar por la borda a varios individuos problemáticos para dar ejemplo y dejarlos morir en las emisiones. Barbas se negó a seguir pagando un porcentaje de sus beneficios a los bandidos y montó un grupo de stalkers para explorar las regiones vírgenes de la Zona. El grupo de Sultán se estableció con fuerza en Skadovsk.
Completar las misiones Decide que hacer y Transacción a favor de los Bandidos y obtén el logro Mandamás
3
Skadovsk siguió siendo el hogar de todos aquellos que tuvieron la suerte de de llegar allí. Los bandidos intentaron imponer su "ley" en la nave, pero los stalkers los mantuvieron a raya y se instalo una frágil tranquilidad en la nave.
Pero esta situación no duro mucho tiempo, los chupasangres de una guarida cercana a Skadovsk consiguieron llegar a la nave y empezaron a atacar a plena luz del día. Unos cazadores decidieron arrasar la guarida pero no consiguieron adentrarse en sus túneles, poco después una oleada de chupasangres aniquilo a todos los residentes de la nave.
No limpie la guarida de chupasangres durante la misión Guarida de los chupasangre.
2
Tras la destrucción de la guarida de chupasangres es poco probable que algo pueda alterar la calma en Skadovsk. La vieja nave se ha convertido en un remanso de paz, un oasis en el perpetuo mundo de cambios de la Zona.
Completa la misión Guarida de los chupasangres con la guardia destruida.
Libertad se gano la confianza de los stalkers de la estación de Yanov. Deber organizó un ataque para intentar recuperar el territorio perdido, y el Teniente Coronel Shulga murió poco después en un tiroteo. El escuadrón de Deber nunca se recuperó de esta perdida y se disolvió rápidamente.
